قسم الجراحة التعليمي وفروعه تأسس في العام الجامعي 2003-2004 ويعتبر قسم الجراحة التعليمي أحد اهم الاقسام في المرحلة السريرية ,بدأت العملية التعليمية فيه بتعاون من اعضاء هيئه التدريس بقسم الجراحة وفروعه بكلية الطب البشري جامعة طرابلس وايضا أساتذة زوار من دوله مصر الشقيقةتحت اشرافعميد الكلية آنذاك ، وتدرس مادة الجراحة وفروعها في المرحلة الثالثة )السنه الرابعة والسنة الخامسة) ويليها بعد ذلك مرحلة التدريب التكميلي (الامتياز) ثلاثة اشهر بأقسام الجراحة العامة والخاصة في أحد المستشفيات التعليمية.